Faune sauvage et contaminants – Zone Atelier Arc Jurassien

Objectif
Observer l’exposition de la faune sauvage aux contaminants, notamment chimiques, et ses effets.

Problématiques

Depuis le début des années 1980, des traitements anticoagulants sont administrés sur des milliers d’hectares sous forme d’appâts pour contrôler l’effet négatif des pullulations de campagnols terrestres sur les prairies. Il peut s’ensuivre une intoxication de la faune non-cible, notamment des prédateurs de campagnols comme la buse, le renard, le milan royal, les sangliers, etc. La traçabilité de ces traitements est assurée par la Fédération régionale de défense contre les organismes nuisibles[fr]Charrue de traitement et piégeage de campagnol terrestre[en]Treatment plough and fossorial water vole trapping

et la Délégation Régionale à l’Alimentation, à l’Agriculture et à la Forêt depuis 1991, avec l’appui de l’UMR Chrono-environnement. Ces données permettent des comparaisons spatiales et temporelles avec les séries concernant la dynamique des populations de campagnol terrestre et de prédateurs, collectées dans le cadre du dispositif Rongeurs – Prédateurs, et du dispositif spécifique « Rapaces » (voir plus bas). Ce dispositif a permis de montrer, par exemple, que les changements de méthodes d’application des traitements ont eu un impact sur les populations de renard dans le Doubs (Jacquot et al. 2013).

Localisation et temporalité
Données anticoagulants annuelles sur l’ensemble du département du Doubs et du Jura, à résolution communale depuis 1991.

Voir aussi:

Coordinateur: ">Michael Cœurdassier

Rapaces

S’appuyant sur le Plan National d’Actions Milan Royal et ses partenaires régionaux et nationaux, un schéma de surveillance mis en place en 2012 par l’UMR Chrono-environnement et la LPO Franche-Comté, vise à collecter et centraliser des informations sur l’exposition aux contaminants chimiques (pesticides, métaux, polluants organiques persistants) de trois populations nicheuses de milan royal.

Ce dispositif a pour objectifs d’évaluer si l’exposition à ces polluants représente un risque d’effets délétères pour les individus et les populations, de caractériser le transfert des contaminants dans les réseaux trophiques et leur évolution temporelle et spatiale, et éventuellement identifier l’émergence de nouveaux contaminants.

Les chercheurs impliqués dans ces suivis participent au programme «EURAPMON – Research and Monitoring for and with Raptors in Europe».

Localisation et temporalité
Trois sites de suivi de nids de milans royaux : Sundgau belfortain, Plateau de Besançon, et Bassin du Drugeon et Remoray, suivi du succès de reproduction, recueil de données morphométriques, baguage et marquage alaire des jeunes, réalisation de prises de sang sur les poussins.

[fr]Localisation des zones d’étude[en]Study area locations

Voir aussi: Nouvelle session de prélèvements de sang sur les poussins de milans royaux

Coordinateur: ">Michael Cœurdassier

Depuis 2013 nous étudions les réponses des micromammifères forestiers (rongeurs et musaraignes) à différentes perturbations anthropiques impliquant des pollutions chimiques (urbanisation, sites industriels, agriculture intensive). Ces travaux visent à caractériser et comprendre les effets de différents stresseurs au niveau individuel, populationnel et des communautés. Ces stresseurs sont en premier lieu des contaminants chimiques, mais nous étudions également leurs interactions avec des contaminants biologiques (pathogènes, dont certains responsables de zoonoses) et le paysage.Les suivis concernent donc la caractérisation des populations de micromammifères par piégeage, l’évaluation de l’exposition des individus à différents polluants (métaux, HAPs, pesticides) et pathogènes (Borrelia ssp, Anaplasma ssp, …), et l’étude de l’état de santé et de l’état nutritionnel des animaux (hématologie, biochimie du plasma, enzymologie).

Ces suivis ont également servis de plateforme opérationnelle pour le développement de méthodes non-létales pour l’étude des micromammifères en écotoxicologie (anesthésie, prise de sang, dosages de contaminants dans des micro-volumes de sang, capture-marquage-recapture, diagnostique de l’état de santé,…).

Localisation et temporalité
Sites en ville (2 à Besançon), forêt (2 en forêt de Chaux), et agricoles (6 répartis sur les départements du Jura, Doubs et de la Haute-Saône)
Suivis au printemps/été

[fr]Localisation des sites d’étude[en]Studysite locations[fr]Mulot sylvestre quittant un dortoir[en]Wood mouse leaving a dormitory

Voir aussi: Premier essais d’expérimentation non-létale « mammifères – contaminants »

Coordinatrice: Clémentine Fritsch

Urbanisation et populations de mésanges

Depuis 2011, un ensemble de 300 nichoirs sont installés à Besançon et en forêt de Chaux, afin de mesurer les effets de l’urbanisation et de l’exposition à certains polluants typiques des milieux urbains sur les performances individuelles des mésanges charbonnières et de mésanges bleues (état de santé, reproduction). Ce suivi s’effectue en collaboration avec le laboratoire Biogéosciences de l’université de Bourgogne/CNRS.

Localisation et temporalité
Sites équipés en forêt de Chaux et dans la ville de Besançon
Suivi au printemps pendant la période de reproduction
[fr]Localisation des zones d’étude[en]Study area locations

Voir aussi :

Coordinateur: ">Renaud Scheifler

Depuis 2010, l’exposition du Petit rhinolophe à des contaminants biologiques (parasites bactériens et protozoaires) et chimiques (métaux, pesticides et insecticides) est mesurée en rapport avec la structure génétique des populations étudiées, et les relations entre les co-expositions biologiques/chimiques.Localisation et temporalité
Vingt-six sites (dortoirs) en Franche-Comté dont certains inclus dans le périmètre de la zone atelier. Collectes occasionnelles d’échantillons, suivi annuel des dortoirs assuré par Chrono-environnement et la Commission de Protection des Eaux, du Patrimoine, de l’Environnement, du Sous-sol et des Chiroptères[fr]Petit rhinolophe[en]Lesser horshoe bat

[fr]Localisation de la zone d’étude[en]Study area location

Voir aussi: Etude rétrospective des populations de chiroptères

Coordinatrice: ">Eve Afonso

[en]

Objective
To monitor the exposure of wildlife to contaminants, especially chemical contaminants, and the effects thereof.

Issues

Anticoagulant rodenticides – AVKs

Since the early 1980s anticoagulant treatments have been administered across thousands of hectares in the form of bait to control the detrimental effect of outbreaks of water voles on grasslands. This has led to intoxication of non-target fauna, especially vole predators such as buzzards, foxes, red kites, wild boar, etc. The traceability of these treatments has been ensured by the Regional Federation for Defence Against Pest Organisms and the Regional Office for Food, Agriculture and Forestry since 1991, with support from the Chrono-Environment Research Unit. These data allow comparisons over time and space with series for population dynamics of water voles and their predators collected as part of the Rodents-Predators scheme and the Birds of Prey scheme (see below). For instance, data from this observatory has shown that changes in methods of treatment have had an impact on fox populations in the Doubs (Jacquot et al. 2013).

Where and When
Rodenticides: annually for the Doubs and Jura départements, at commune resolution, since 1991;

See also…

Impact of rodenticides on vole and predator populations

Coordinator: ">Michael Cœurdassier

Birds of Prey

Backed by the Red Kite National Action Plan and its regional and national partners, a surveillance scheme was set up in 2012 by UMR Chrono-Environment and LPO Franche-Comté to collect information about the exposure of three nesting populations of red kites to chemical contaminants (pesticides, metals, persistent organic pollutants).
The scheme is designed to evaluate whether exposure to these pollutants entails a risk of harmful effects for individuals and populations, to describe patterns of contaminant transfer in foodwebs and their changes over time and space, and possibly to detect the emergence of any environmental contaminant.

The scientists involved in this research participate in the programme «EURAPMON – Research and Monitoring for and with Raptors in Europe».

Where and When
Three sites for nest survey: Sundgau belfortain, Plateau de Besançon and Bassin du Drugeon et Remoray – monitoring of successful breeding, collection of morphometric data, ringing and wing marking of young, blood sampling from chicks.

[fr]Localisation des zones d’étude[en]Study area locations

Coordinator: ">Michael Cœurdassier

Since 2013, we have been studying the responses of forest small mammals rodents and shrews) to different anthropogenic disturbances which imply chemical pollution (urbanization, industrial sites, intensive farming). This work aims at characterizing and understanding the effects of various stressors at individual, population and community levels. These stressors are basically chemical contaminants, but we also study their interactions with biological contaminants (pathogens, including some zoonosis agents) and landscape.The monitoring scheme deals with the characterization of small mammals populations using trapping, the assessment of individual exposure to pollutants (metals, PAHs, pesticides) and pathogens (Borrelia ssp, Anaplasma ssp, …), and the study of animal health state and nutritional state (haematology, plasma biochemistry, enzymology).

The survey has also been used as a platform for the development of non-lethal methods for small mammal studies in ecotoxicology (anaesthesia, blood sampling, measurements of pollutants in blood micro-volumes, capture-mark-recapture, health state diagnose, …)

Where and When
Sites in city (2 in Besançon), forest (2 in Forêt de Chaux), and farmland (6 spread in the départements of Jura, Doubs and Haute-Saône)
Monitoring in spring/summer

[fr]Localisation des sites d’étude[en]Studysite locations[fr]Mulot sylvestre quittant un dortoir[en]Wood mouse leaving a dormitory

Coordinator: Clémentine Fritsch

Urbanisation and tit populations

Since 2011 some 300 nest boxes have been set up in Besançon and the Forest of Chaux to measure the effects of urbanisation and exposure to some pollutants typical of urban environments on the individual performances of great and blue tits (state of health, reproduction). This monitoring is done in cooperation with the Biogeoscience department (University of Burgundy/CNRS).

Where and When
Sites in the Forest of Chaux and Besançon. Monitoring in spring during the breeding season.
[fr]Localisation des zones d’étude[en]Study area locations
Coordinator: ">Renaud Scheifler

Since 2010 the exposure of the lesser horseshoe bat to biological contaminants (bacterial and protozoan parasites) and chemical contaminants (metals, pesticides and insecticides) has been measured in relation to the genetic structure of the populations studied,and relationships between biological and chemical exposures.Where and When
Twenty-six sites (roosts) in Franche-Comté, some of which are within the ZAAJ. Sporadic sampling, annual monitoring of roosts by the Chrono-Environment department and the CPEPESC[fr]Petit rhinolophe[en]Lesser horshoe bat

[fr]Localisation de la zone d’étude[en]Study area location

Coordinator: ">Eve Afonso